Я думаю, что нет никакого правильного ответа на ваш вопрос. Chosing структура является вопросом философии и личными предпочтениями. Некоторые люди будут думать, что Yii легче использовать, и некоторый другой будет поражен возможностями симфонии.
Если вы будете знать структуру, я буду советовать вам придерживаться этого и если вы не проверяете основание каждого и выбираете тот, который, кажется, соответствует вашей потребности больше всего.
Но в конце, если вы выбираете популярную структуру (Yii, Symfony, Laravel...) вы будете в состоянии достигнуть своей цели.