Как я могу поместить свой .ini файл в папку, где мой ТАК освобождает?
AFAIK, вы не можете.
Использование собственного кода этот .ini от ApplicationPath
Пожалуйста, перепишите собственный код, чтобы быть менее смущающими, при наличии его берут путь в качестве параметра к функции JNI.